對皮膚的作用
進行各種水療法時，水首先在皮膚產生作用，皮膚具有各種周圍神經末梢和豐富的血管網，故水療的程度、機械及化學刺激因素除刺激局部皮膚外，還可以反射性地引起偏遠部位器官發生各種不同反應。
如熱水坐浴可引起盆腔內充血;手浴能影響胸腔臟器;足浴能影響腦部血液循環。
對神經系統的作用
皮膚有豐富的感受器，冷熱刺激后，由向心神經傳導到中樞而起各系統的反應。由于溫熱刺激在大腦皮膚可引起抑制過程，故進行溫水或不感溫水全身浸浴時有鎮靜作用，治療后嗜睡。
短時間的熱水浴(40 ℃， 1-2 分鐘 ) 可致興奮，但長時間的話，則可能導致疲勞、軟弱、欲睡。
冷刺激亦有興奮作用，如民間常用冷水噴頭臉部以幫助昏迷者更醒。短時間的冷療法還可提高交感神經的緊張度，發揮強身作作用。冷刺激能鍛煉周圍神經系統的功能，長時間則會使神經系統的興奮性降低，因此可用冷凍進行麻痹及替炎癥部位鎮痛。
不感溫對皮膚刺激性非常小。不感溫浸浴能使從周圍到大腦皮膚的沖動減少，因此可減輕中樞神經系統的負擔，使其得到期休息，從而增強其抑制過程，起鎮靜作用。
對心血管系統的作用
水療對心血管系統的作用與水溫、治療時間、部位及刺激強度有密切關系。心臟局部冷敷時，能使心臟收縮次數減少，但收縮力加強，脈搏有力，血壓下降。
心臟部熱敷時，使心搏加速，在適當情況下也可能增加心肌張力;但如溫度超過39 ℃或治療時間時，心臟張力即行減低。
當實性心動過速時，心臟部冷敷可獲良好效果。但若是心臟本身疾病如心肌炎、內膜炎所致的心搏增快，則須長時間的局部冷敷，每日 2-3次，每日 2-3 小時，可使心臟本身溫度降低而使心搏次數減少。
