隨著病情發展，患者會出現嗜睡、興奮、抽搐等神經系統的表現。腦炎患兒早期往往容易被誤診為傷風、感冒，錯失治療的佳時機。
因此孩子出現感冒癥狀，精神行為異常，嬰幼兒表現為不肯吃奶、頭痛，經過一般的感冒治療無效時，應高度警惕腦炎的可能性，及時帶孩子到正規醫院找專科醫生進行排查。
腦炎后遺癥臨床表現
①失語、語言遲鈍、癱瘓、吞咽困難、視神經萎縮、耳聾、癲癇等神經系統損害。
②癡呆、記憶力及理解減退、智力低下、表情淡漠、眼神呆滯、哭笑無常、攻擊性行為、易激惹、興奮多動等精神狀態及認知功能異常。
③多汗、流涎等自主神經功能失調。
細菌性腦膜炎后嚴重后遺癥，包括意識障礙、雙側聽力喪失、運動障礙、癲癇、視力障礙、腦積水。
較輕后遺癥，包括行為問題、學習困難、單側聽力喪失、肌張力減低、復視。
