巧克力囊腫是子宮內膜異位癥在卵巢的病變形式，其嚴重程度不一。

一、不嚴重的情況：巧克力囊腫的形成多與逆行月經、異位種植、淋巴性播散、腹腔上皮細胞化生以及免疫系統紊亂等因素有關，這些因素會使子宮內膜細胞增多并粘附在卵巢表面持續生長從而出現囊腫。部分患者起初可能無明顯癥狀，而當巧克力囊腫增大到一定程度，會出現盆腔疼痛、痛經、性交出血以及腹瀉等表現。一旦出現這些癥狀，及時采用激素療法或手術切除等方式進行處理，通常能有效控制病情，對身體影響相對較小。

二、嚴重的情況：若患者未及時就醫治療而任由病情發展，可能引發不孕等并發癥，這種情況下較為嚴重。此外，若囊腫破裂，其內容物會污染周圍組織，進而誘發劇烈疼痛，這也會比較嚴重。

總之，如果患有巧克力囊腫，應盡快前往醫院就診治療。治療的根本目的在于縮小和去除病灶、減輕和控制疼痛、治療和促進生育以及預防和減少復發。