輪船
廈門港是中國沿海主要港口之一，歷史上就是中國東南沿海對外貿易的重要口岸。廈門港水深浪低，是我國南方的天然良港，港內實行24小時通航。除省內開往沿海各線外，還有向南開往汕頭、廣州、海南島，向北開往大連、天津、青島、煙臺、南京、鎮江、上海等地的航線。廈門本地的航線有主要有發往鼓浪嶼、金門等地。其中金門是大陸據臺灣近的縣市，在金門的海岸邊可以遠眺臺灣島。除此之外廈門港每周還有千萬香港和臺灣的客船(臺灣線只對臺胞、臺商等人群開放)。
廈門——香港：每周三下午5點從廈門開往香港，每周二下午2點從香港開往廈門。
廈門——臺灣：廈門和平碼頭到臺灣金門水頭碼頭，航程40分鐘左右，票價180元人民幣，不過目前暫時只對臺胞、臺商等人群開放。
長途客運
廈門現有三個主要的長途客運站：集美長途汽車站(島外)，湖濱車站與松柏車站(本島)。如果從上海、浙江、廣東方向進入廈門，坐高速大巴是很好的選擇。
車站售票大廳會提供自助查詢機，可以查到新的汽車、火車時刻以及公交線路信息。此外，機場路口的售票點和集美汽車站都可以買票等車。
目前有六座大橋(隧道)鏈接廈門島，分別是高集海堤、廈門大橋、海滄大橋、集美大橋、杏林大橋、翔安隧道，還有四條在建。公路前往廈門市相當的方便。
【集美長途汽車站】
地址：廈門市集美區銀江路159號。
主營業務：全國各主要大中城市的長途車。
電話：0592-6068319
【湖濱長途汽車站】
地址：廈門市思明區湖濱南路59號。
主營線路：珠海線路。
電話：0592-2215533
周邊：出門向左為公交車站電子城站。
【松柏長途汽車站】
與湖濱長途汽車站的班次基本一致，較前者晚15—20分鐘
地址：廈門市思明區蓮岳路211號
主營線路：福州線路
電話：0592-5089328
周邊：往火車站方向815路經停門前停車場。附近馬路邊為武夷工貿站。
