腰兩側肌肉痛的原因可能有以下幾種：

1.肌肉勞損：長時間保持同一姿勢或過度使用腰部肌肉，可導致肌肉疲勞和酸痛。

2.扭傷或拉傷：腰部肌肉受到外力扭傷或拉傷，可引起疼痛和腫脹。

3.腰椎間盤突出：突出的椎間盤可能壓迫神經根，導致腰部及臀部疼痛，并可向下肢放射。

4.泌尿系統疾病：如腎炎、腎結石等，也可引起腰部肌肉疼痛。

5.脊柱關節炎：可導致腰部及脊柱疼痛、僵硬。

6.其他：婦科疾病、感染、腫瘤等也可能引起腰部肌肉痛。

對于長期或嚴重的腰兩側肌肉痛，應及時就醫，進行詳細的檢查，以明確病因，并采取相應的治療措施。同時，在日常生活中，應注意保持正確的姿勢，避免過度勞累，適當進行腰部肌肉的鍛煉。對于特殊人群，如孕婦、老年人等，腰部肌肉痛可能與生理變化或疾病有關，更應重視并及時就醫。