HPV疫苗主要區別在于預防的HPV病毒亞型種類，二價、四價和九價疫苗適用人群、接種程序和價格也可能不同，接種HPV疫苗后仍應定期篩查，接種有禁忌癥，需咨詢醫生。

二價HPV疫苗適用于9至45歲的女性，四價HPV疫苗適用于20至45歲的女性，九價HPV疫苗適用于16至26歲的女性。二價HPV疫苗需要接種三針，分別在第0、1和6個月進行；四價HPV疫苗也需要接種三針，分別在第0、2和6個月進行；九價HPV疫苗則需要接種三針，分別在第0、2和6個月進行。二價HPV疫苗的價格相對較低，四價和九價HPV疫苗的價格則相對較高。

需要注意的是，HPV疫苗并不能預防所有的HPV病毒感染，因此接種HPV疫苗后仍應定期進行宮頸癌篩查。此外，HPV疫苗接種有一定的禁忌癥，如對HPV疫苗的成分過敏、懷孕或哺乳期女性等。在接種HPV疫苗前，應咨詢醫生，了解自己是否適合接種HPV疫苗。