男生腎疼的原因包括以下幾種：

一、尿路結石：當尿路結石卡在輸尿管，尤其是處于三個生理狹窄處時，會引發尿路梗阻，進而導致腎絞痛出現。這種疼痛常常在深夜至凌晨發作，主要表現為腰部疼痛不適，還可能伴有血尿、惡心、嘔吐、面色蒼白、出冷汗甚至休克等癥狀。

二、尿路感染：多見于上尿路感染患者。由于炎癥對腎臟造成損傷，引發腎乳頭壞死和腎周膿腫，會使患者出現腰部疼痛不適、血尿，同時可能伴有發熱。

三、腎囊腫：腎囊腫體積較小的患者通常不會有明顯臨床癥狀。但當腎囊腫體積增大超過5厘米時，囊腫會對周圍組織產生壓迫，從而出現腰部脹痛不適、疼痛等表現。

四、腎臟腫瘤：當腎臟腫瘤體積較大時，會對腎臟周圍組織形成壓迫，進而導致腰部疼痛不適。

總之，男生腎疼可能由多種原因引起，包括尿路結石、尿路感染、腎囊腫和腎臟腫瘤等，不同原因導致的癥狀各有特點，需要仔細辨別和診斷。