寶寶眼睛被蚊子叮腫后的處理方式包括使用生理鹽水清洗、外用藥物、口服藥物等。同時還有一些注意事項需要遵守。具體如下：

一、處理方式：

1.生理鹽水清洗：當寶寶被蚊子叮咬后癥狀較輕，僅有輕微紅腫且瘙癢感不明顯時，可考慮使用生理鹽水進行清洗，能一定程度上緩解瘙癢和局部腫脹。

2.外用藥物：由于寶寶皮膚嬌嫩，若蚊蟲叮咬后出現水腫或感染情況，需在醫生指導下使用一些外用藥物治療，如莫匹羅星軟膏、紅霉素軟膏等。

3.口服藥物：要是寶寶被蚊蟲叮咬后出現過敏反應，則要盡快進行抗過敏治療，可在醫生指導下使用氯雷他定或西替利嗪等藥物來緩解局部過敏反應。

二、注意事項：

1.在蚊蟲較多的季節，要將門窗關好，避免蚊蟲進入室內。

2.盡量減少寶寶在戶外的時間，以降低被蚊蟲叮咬的幾率。

總之，寶寶眼睛被蚊子叮腫后要根據具體情況選擇合適的處理方法，并注意做好相關防護措施。