嬰兒腹瀉的原因包括飲食不當、感染和其他因素。飲食因素如喂食過多、過少、不定時、食物成分不適宜等可導致消化不良，感染因素中病毒、細菌感染多見，嬰兒消化系統發育不成熟、防御功能差等也是導致腹瀉的原因。

1、飲食因素：喂養不當可導致嬰兒腹瀉，如喂食過多、過少、不定時，食物成分不適宜，過早喂食大量淀粉或脂肪類食物等都可導致消化不良，引起腹瀉。

2、感染因素：腸道內感染可由病毒、細菌、真菌、寄生蟲引起，以前兩者多見，尤其是病毒。

3、其他因素：嬰兒消化系統發育不成熟，胃酸和消化酶分泌少，酶活力偏低，不能適應食物質和量的較大變化；生長發育快，所需營養物質相對較多，消化道負擔較重，容易發生消化道功能紊亂；機體防御功能差，胃酸偏低，血液中免疫球蛋白和胃腸道分泌型免疫球蛋白均較低，易患腸道感染。