三個月寶寶嘴巴里面長白點點，其原因可能有以下幾種：一是口腔衛生不好，二是出現了鵝口瘡，三是患上了皰疹性咽峽炎。

一、口腔衛生不好：如果寶寶吃完奶后沒有及時進行清潔，奶液就可能會附著在口腔內壁上，從而出現白點點。這種情況通常只要注重寶寶口腔衛生的維護就能改善。

二、鵝口瘡：這是臨床上較為常見的情況。當出現鵝口瘡后，是由于口腔受到真菌感染，進而導致口腔黏膜受損，使得口腔黏膜發生病變，出現白點點。這種感染可能與寶寶免疫力較低、接觸了感染源等因素有關。

三、皰疹性咽峽炎：部分寶寶患上皰疹性咽峽炎后，因病毒入侵感染口腔黏膜，可能會造成組織損傷，進而引發白點點的出現。一般還會伴有發熱、咽痛等癥狀。

總之，當發現三個月寶寶嘴巴里有白點點時，需要仔細觀察并結合寶寶的具體癥狀來判斷原因，必要時應及時就醫進行診斷和處理，以保障寶寶的口腔健康。