扁桃體肥大可出現咽異物感、睡眠時打鼾，過度肥大也可出現呼吸困難、吞咽不暢或言語含糊不清，但皆少見。

臨床上常將扁桃體按其大小分為三度，I度肥大：扁桃體不超過腭舌弓和腭咽弓；II度肥大：超過腭咽弓；III度肥大：兩側扁桃體接近中線或互相接觸。

除三度肥大較有診斷意義外，單憑大小以診斷慢性扁桃體炎是不可靠的。因3歲以下兒童其扁桃體多呈生理性肥大；成人的慢性扁桃體炎，扁桃體多呈萎縮型，體積雖小，有時危害更大。

扁桃體過度肥大，可妨礙吞咽、呼吸及發聲，或因扁桃體肥大導致阻塞性睡眠呼吸暫停低通氣綜合征。

扁桃體過度肥大多見于兒童，出現上述情況，可行扁桃體切除術。