根管治療第一次時把壞死的牙神經基本上去除了，一般根管治療第二三次不會特別疼。如果髄腔內殘余牙神經，則會引起疼痛。如果很痛，可局部注射麻醉藥物再進行根管治療，可有效緩解疼痛。

根管治療第二次第三次基本沒有任何疼痛反應，因為此時的牙神經以及通過藥物的作用失活，那么無法對外界的機械物理等刺激做出任何反應，所以就沒有疼痛感，即使有疼痛，通常也是很輕微的。建議做根管治療的患者，一定要按照醫囑積極配合，第一次治療完成以后，一定要盡量少用患牙進行咀嚼以及撕咬，還要注意口腔衛生。