小兒消化性潰瘍與很多其他消化病類似，很多時候會因為疏忽而做出錯誤的判斷，那么小兒消化性潰瘍容易和哪些疾病混淆呢?
1、嘔血的鑒別
除胃及十二指腸潰瘍外，嬰兒時期的嘔血，可見于新生兒自然出血癥、壞血病、食管裂孔疝等。兒童時期的哎血，可見于紫癜、血友病、重度貧血、肝硬變(胃及食管靜脈曲張)、慢性充血性脾大、脾靜脈血栓形成等。有時吞咽異物致胃部受傷而出血，或因鼻咽出血被吞咽后再從胃部嘔出。
2、血便的鑒別
胃及十二指腸潰瘍出血多為柏油樣便，紅色血便見于大量出血。主要應與腸套疊、腸重復畸形、回腸遠端憩室出血、腸息肉、腸傷寒、過敏性紫癜及其他血液病等鑒別。
3、腹痛的鑒別
與潰瘍相似的腹痛者腸痙攣、腸寄生蟲病、膽道痙攣、膽道蛔蟲等。長期有規律性劍突下疼痛者，可考慮作鋇餐松樹檢查以協助診斷。一種少見的遺傳病Zollinger-Ellison綜合征，以間發性腹痛、嘔血、便血、腹瀉、脂肪瀉為主要癥狀，胃酸顯著增多，存在非β胰島細胞腫瘤，須與潰瘍病鑒別。此綜合征患兒血內促胃泌素極高。可助診斷。