新生兒鵝口瘡是可以預防的，每次喂完新生兒后，記得給新生兒喝幾口溫開水，目的是為了漱口，長期堅持，新生兒鵝口瘡就沒那么容易滋生了。
新生兒口腔有鵝口瘡，可用棉花千蘸些制霉菌素溶液(每10毫升冷開水中含20萬單位制霉菌素)涂在口腔患處，或用1%龍膽紫涂口腔;或用2～3%碳酸氫鈉(小蘇打)溶液洗口腔;或涂些冰硼散或硼砂甘油。以上藥物每天可涂3～4次。
吃奶后用1%龍膽紫溶液滴于新生兒的舌下，讓其舌頭活動而轉涂到整個口腔。一般每日滴2～3次，同時補充復合維生素B和維生素C，每日二次，每次各一片，壓碎成粉，加水溶解后喂。
新生兒鵝口瘡是可以預防的，平時只要注意口腔護理，每次喂奶后再喂幾口溫開水，可沖去留在口腔內的奶汁，這樣霉菌就不會生長了，此外，于每次喂奶前，先將奶頭揩凈，雙手也要洗干凈。新生兒所用食具，應煮沸消毒后才可使用。
孩子得了鵝口瘡以后，應檢查有沒有不合理使用抗菌素的情況，如有，應及時糾正。然后用2%小蘇打水含漱或擦洗口腔，涂制霉菌素藥水或中藥冰硼散等，輕癥者即可以痊愈，重癥鵝口瘡則應口服制霉菌素，1～3歲1萬單位，1歲以內7.5萬單位，每日3次。