骨髓炎的分類有多種形式，根據其感染途徑可分為：①血源性骨髓炎：由身體其他部分的化膿性病灶經血液循壞傳播至骨內。②外傷性骨髓炎：由外傷創口感染引起，如開放性骨折繼發的骨髓炎。③感染性骨髓炎：由附近軟組織感染直接蔓延而成，如膿性指頭炎引起的骨髓炎。
骨髓炎根據病情發展可為急性和慢性兩類。從急性骨髓炎到慢性炎是一個逐漸發展的變化的過程，不能機械地按時間劃分。急性炎癥消退后，若有死骨、有竇道、有死腔即為慢性骨髓炎。急性骨髓炎包括急性化膿性骨髓炎、亞急性骨髓炎、急性髂骨性骨髓炎和急性脊椎性骨髓炎。慢性骨髓炎包括慢性化膿性骨髓炎、局限性骨髓炎、硬化性骨髓炎和結核性骨髓炎。
骨髓炎根據發病部位及病理改變的不同還可分為顱骨化膿性骨髓炎、頜骨化膿性骨髓炎和指(趾)骨化膿性骨髓炎等。全身有兩個以上部位發病的稱全身我發性骨髓炎。
臨床上骨髓炎的分類命名，是根據其發病部位、病程、感染途徑、臨床表現綜合命名的。中醫則在骨髓炎分類的基礎上辯證分型施治，如急性血源懷骨髓炎非化膿期屬余毒濕熱型型的，則以解表祛邪、透邪外出為治則。