如果兩眼在遠視的消減程度或近視的發展進度不同，就可引起屈光參差。先天因素者，出生時就有明顯的兩眼眼軸發育不平衡，兩眼的屈光狀態不相對稱;另外，眼外傷、眼的手術也可造成屈光參差。
一、可以引起屈光參差的因素主要包括
1.發育因素
在眼的發育過程中，遠視的度數在不斷減輕，而近視的度數在不斷發展，如果兩眼的發展進度不同，就可能引起屈光參差。
2.雙眼視功能的異常
屈光參差經常發生于斜視之后，主要是由于斜視影響或者說破壞了眼球正視化的過程，打斷了雙眼視功能的發育。
3.外傷和其他疾病亦可引起屈光參差
上瞼下垂患者屈光參差的發病率大約為55%，其他如眼瞼血管瘤，視網膜病變(玻璃體積血等)，核性白內障等。
4.手術因素
一些手術可造成人為的屈光參差，如人工晶體的植入，角膜移植，RK術等。
按照其發病病因可以進行如下分類：遺傳性(hereditary)，包括先天性青光眼，先天性白內障和一些導致眼瞼閉合的疾病，如先天性動眼神經麻痹，上瞼下垂等;獲得性(acquired)，包括外傷性，球內或球周占位性病變以及醫源性因素，如單眼晶狀體摘除后的無晶狀體眼，屈光手術，穿透性角膜移植等。
二、屈光參差的發病機理
屈光參差性弱視的發病機理是由于雙眼的屈光度數相差較大，外界景物在左右兩眼黃斑部所成像的大小不等，醫學上稱不等視，因兩眼屈光參差較大，兩眼不同視，兩眼視網膜成像大小清晰度不同或大小差別太大，屈光度較高的一眼黃斑部成像大而模糊，引起二眼融合反射刺激不足，不能形成雙眼單視，從而產生被動性抑制，這樣被動性和主動性抑制同時存在，導致皮質中樞只能抑制屈光不正較大眼睛的物象，日久遂發性弱視，這類弱視也是功能性的，因而可逆的。
兩眼屈光相并3.00D以上者，屈光度較高常形成弱視和斜視。弱視的深度不一定與屈光參差的度數有關，但與注視性質有關，旁中央注視者弱視程度較深，這類弱視的性質和斜視性弱視相似，是功能性的和可逆的。臨床上有時也不易區分弱視是原發于屈光參差，還是繼發于斜視，此型如能早期發現，及時配戴眼鏡，可以預防。