在性功能障礙治療的過程中，第一步是要了解患者的病因，弄清楚了病因才可以進行根本性的治療，而且所采用的治療方法的適當與否也是使治療取得效果的關鍵。下面看一下主要的治療性功能障礙的方法有哪些。
現在可以治療性功能障礙的方法其實很多，不但有藥物，還有儀器治療等。運用尖端的射精障礙診斷治療儀，通過專用器具施治于人體陰莖及有關穴位，調節大腦皮質功能，興奮脊髓性中樞活動，擴張陰莖動靜脈血管，激活海綿體動力、增粗陰莖海綿體的體積等整體治療效果，是目前非藥物治療男性射精障礙的先進治療設備。
如果患者的陰莖存在著勃起障礙，則應該通過一定的方法讓陰莖勃起得以恢復。通過真空負壓、抽吸訓練，興奮脊髓性功能中樞，幫助陰莖勃起，增強陰莖海綿體血液充盈和減少血液回流，提高陰莖硬度和維持勃起時間，增加陰莖肌肉活力改善陰莖的主動勃起功能。同時，利用模擬陰道溫度，中藥液按摩及電脈沖等功能，有效地調節陰莖的被動勃起功能。
因此，性功能障礙治療可以采用藥物，也可以采用一些專用儀器或者通過真空負壓、抽吸訓練等專用方法進行治療，所以性功能障礙患者的選擇性是比較多的，主要還是患者要能夠主動與大夫配合好。