典型結腦的臨床表現可分為三期
1.前驅期(早期)約1 ～2周，一般起病緩慢，在原有結核病基礎上，出現性情改變，如煩躁、易怒、好哭，或精神倦怠、呆滯、嗜睡或睡眼不寧，兩眼凝視，食欲不振、消瘦，并有低熱，便秘或不明原因的反復嘔吐。年長兒可自訴頭痛，初可為間歇性，后持續性頭痛。嬰幼兒表現為皺眉、以手擊頭、啼哭等。
2.腦膜刺激期(中期)約1 ～2周 主要為腦膜為及顱內壓增高表現。低熱，頭痛加劇可呈持續性。嘔吐頻繁、常呈噴射狀，可有感覺過敏，逐淅出現嗜睡、意識障礙。典型腦膜刺激征多見于年長兒，嬰兒主要表現為前囟飽滿或膨隆，腹壁反射消失、腱反射亢進。若病情繼續發展，則進入昏迷狀態，可有驚厥發作。此期常出現顱神經受累病狀，最常見為面神經、動眼神經及外展神經的癱瘓，多為單側受累，表現為鼻唇溝消失、眼瞼下垂、眼外斜、復視及瞳孔散大，眼底檢查可見視神經炎，視乳突水腫，脈絡膜可偶見結核節結。
3.結核性腦膜炎晚期(昏迷期)約1 ～2周 意誤障礙加重反復驚厥，神志進入半昏迷、昏迷狀態，瞳孔散大，對光反射消失、呼吸節律不整甚至出現潮式呼吸或呼吸暫停。常有代謝性酸中毒、腦性失鐵鈉綜合征、低鉀積壓癥等水、電解質代謝紊亂。最后體溫可升至40℃以上，終因呼吸循環衰竭而死亡。