使用眼藥水后眼睛刺痛，可能是操作不當、眼藥水的刺激作用、眼部疾病本身等原因引起的。

1.操作不當

使用眼藥水時，如果瓶口接觸到眼睛或眼瞼，可能會刺激角膜或結膜，引起疼痛。此外，滴眼藥時壓迫淚囊、眨眼次數過少等也可能影響眼藥水的吸收，導致疼痛。

2.眼藥水的刺激作用

部分眼藥水可能含有防腐劑、藥物成分等，直接接觸結膜囊時會引起短暫的刺痛。這種刺痛通常是輕微的，會在數秒至數分鐘內自行緩解。

3.眼部疾病本身

如果眼部存在炎癥、感染或其他疾病，眼藥水可能會刺激病變組織，導致疼痛加重。比如，結膜炎、角膜炎等患者使用眼藥水后可能會感覺更痛。