腎結石患者一定要做尿液檢查，對判斷腎結石成分相當有價值。其次是血清生化基本檢查，該檢查是電解質、二氧化碳結合力、肌酐、尿酸的化驗，然后是X線、B超、CT掃描。最后是靜脈尿路造影和磁共振水成像。具體分析如下：
1、尿液常規檢查
蛋白陰性或微量，鏡檢可見到紅細胞，亦可見到白細胞。尿培養可能有細菌生長，有時尿中可見到各種結晶和結晶團塊。特征性的尿液結晶對結石類型的診斷有意義。草酸鈣結石尿中可見假管狀草酸鈣結晶;尿酸結石尿中可見復合體結晶;胱氨酸結石尿中可見六角形結晶。尿液酸堿度隨結石成分而異，感染性結石和磷酸鈣結石尿pH>6，并見有細菌，需行尿細菌學培養及藥敏試驗;尿酸結石和草酸鈣結石尿pH較低。
2、血清生化基本檢查
電解質(鈣、磷、鉀、鈉、氯)、二氧化碳結合力、肌酐、尿酸。如果血鈣高或在正常高限，尤其血磷低，需要檢查甲狀腺功能。如有低鉀血癥和血碳酸氫根濃度降低，可能存在低枸櫞酸尿癥。
3、尿路X線平片
腎結石患者無明確禁忌證，都需行此項檢查。X線平片必須包括全泌尿系。尿路X線平片可以發現90%左右的不透X線結石，能大致確定結石位置、形態、大小、數量。對是否需要進一步檢查提供基本資料，可作為結石檢查的常規方法。草酸鈣顯影最好;磷酸鈣、磷酸鎂銨顯影稍差;含鈣的胱氨酸、尿酸鹽結石顯影較磷酸鈣、磷酸鎂銨稍差。單純尿酸和黃嘌呤結石為透X線結石;胱氨酸結石密度低，在X線平片上顯影比較淡。
4、靜脈尿路造影
這一檢查可了解腎解剖及功能狀態，如腎盂屬腎內型或腎外形、腎盂輸尿管連接部狹窄、多囊腎以及是否有腎積水的存在等。陰性結石在顯影的腎盂內表現為透明區，類似占位性病變。在腎功能較差，顯影欠佳時，可試用大劑量造影劑的造影術。必要時也可考慮行逆行性尿路造影。
5、B超
超聲檢查簡便、經濟、無創傷，可發現2mm以上不透或透X線的結石。由于受腸腔積氣的影響，對于輸尿管中下段結石的敏感性較低，可與尿路X線平片聯合使用。超聲檢查還可以發現結石以上尿路擴張情況，