胎兒時期心臟發育的障礙所引起的心臟畸形就是導致小兒先天性心臟病最主要的原因，并且嚴重威脅小兒的健康。
小兒先心病
1.先天因素中，有先天性心臟病家族遺傳史。兄弟姐妹同時患先天性心臟病、父母與子女同時患先天性心臟病的情況頗不少見了，而且其疾病性質甚為近似。若母親所生的第一胎患有先天性心臟病，第二胎患病的可能性為2%左右;若連續兩胎皆為先天性心臟病者，再生的先天性心臟病兒可能增至10%。若母親患有先天性心臟病，第二代患先病的危險性為10%。其他的皆為后天因素。
2.孕婦患有糖尿病而未經治療和控制病情者，可致胎兒先天性心臟病的危險性為2%，如果妊娠早期病情控制穩定，則危險性下降。
3.孕婦在妊娠早期接觸致畸藥物，如鋰、苯妥英鈉或類固醇等，都可導致胎兒先天性心臟病的患病率達到2%。
4.妊娠早期受到放射性物質如X射線、同位素等過量照射。
5.病毒感染。婦女在懷孕最初3個月，特別是懷孕3周-8周，如遭到病毒感染，胎兒易發生心臟血管畸形。其中風疹病毒是引起胎兒先天性心臟病的主要罪魁禍首。此外，流感、流行性腮腺炎、柯薩奇病毒、皰疹病毒等也往往是小兒先天性心臟病的誘因。