扁桃體炎：通常所說的扁桃體其實是腭扁桃體，因為人類除了腭扁桃體外，還有咽扁桃體、咽鼓管扁桃體和舌扁桃體，這些共同組成了咽淋巴環的內環。腭扁桃體是 一對扁卵圓形的組織，位于扁桃體窩內，它的表面有一些小的凹陷，稱為扁桃體隱窩。當扁桃體發生炎癥的時候，脫落上皮、淋巴細胞及細菌會堆積在隱窩開口處， 此時扁桃體表面就會出現點狀豆渣樣物。
急、慢性扁桃體炎都可以引起多種并發癥。
局部并發癥：有急性中耳炎、鼻炎、鼻竇炎、咽炎、頸淋巴結炎、扁桃體周圍膿腫等。
全身并發癥：常見的有風濕病、急性腎小球腎炎、敗血癥、關節炎、皮膚疾患(如銀屑病)、心肌炎、支氣管哮喘等。
扁桃體炎引起全身疾病的機理目前尚不完全明了。感染學說認為是溶血性鏈球菌及其毒素間斷地進入血流或淋巴，導致遠隔部位的疾病。近年來由風濕病患者 的咽部、血液和心瓣膜上分離出Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅶ型腺病毒，并認為鏈球菌的透明質酸酶能增加咽部組織的通透性，使病毒易于侵入人體而致病。
變態反應學說認為小窩內的細菌及其毒素、代謝產物或病毒等，進入體液后，可引起抗體形成，通過抗原抗體結合，產生復合物而導致其他部位的病變。感染變態反應學說認為上述兩種 過程同時存在，共同起作用。此外，尚有其其它說法，但各種學說都缺乏足夠的證據。