門靜脈高壓癥的治療從病因下手才是最根本的治療，比如所有肝內型的病例最好的治療手段就是肝移植，肝臟的問題解決了，門靜脈自然暢通了，門靜脈壓力也就下來了。沒有條件肝移植的病人則已控制肝臟病變進展為主要目的，移植肝炎病毒，減輕肝臟纖維化程度等。而肝后型則要從如何打通肝臟血液流出道方面考慮，如果是布加綜合征可以考慮用介入的方法或做布加綜合征根治術，縮窄性心包炎部分情況也是能夠做手術解決的。肝前型的治療手段比較少，門靜脈本身的病變很難通過手術治好，往往只能對癥治療。
內科治療
1.一般治療和飲食治療門靜脈高壓病人病情穩定而無明顯其他并發癥時可根據以下原則綜合治療以針對病因或相關因素治療為主
(1)休息：門靜脈高壓病人在肝功能代償期一般不強調臥床休息，病情輕微者可適當參加一般工作但應適當減少勞動時間及勞動強度，注意勞逸結合，以不感覺疲勞為宜。病情較重或近期曾有消化道大出血等并發癥者應停止工作以保證有足夠的臥床休息及睡眠時間，防止疲勞，休息可利于肝臟微循環的改善促進肝細胞再生修復減輕肝損害
(2)飲食：由于病人整個胃腸道功能受到影響，因此應給予高熱量易消化的軟食，對于慢性肝病病人通過合適的飲食可以補充營養、改善肝臟代謝、增強機體抵抗力、促進肝細胞再生修復，并能防止各種并發癥的發生。原則上宜給予熱量充足、富含各種維生素的食物，食物中除含有高糖、高蛋白質(有肝性腦病者應限制蛋白質攝入)、適當脂肪、維生素外還應含有各種無機鹽及微量元素。食物以軟食為主，應避免堅硬粗糙食物對食管胃黏膜造成機械損傷引起出血的風險，盡量控制辛辣刺激性食物，嚴禁飲酒。
(3)腹水的治療：腹水的出現是肝臟功能受損達一定程度的表現，肝功能愈差腹水愈難消除，所以腹水的治療重在糾正和恢復肝臟功能。如病人腹水較多則需要給予補充白蛋白配以利尿藥增加水納的排出、頑固性腹水有時只能腹腔穿刺放液來減輕患者的不適癥狀。