預防先天性腦積水的關鍵是消除腦積水形成前的危險因素和胎兒期、圍產期導致此疾病的因素。這些因素的預防就可以在很大程度上預防先天性腦積水的發生。
如何預防先天性腦積水
首先，加強產前早期診斷，及早終止妊娠，一般來說，產前早期診斷是預防先天性腦積水的重要途徑，明顯的腦積水患兒可在孕12—18周通過B超查出，一旦查出應及早終止妊娠，預防腦積水患兒的出生。
其次，也是最根本的，需要消滅和改善遺傳因素與環境因素，先天性腦積水是由遺傳因素和環境因素共同作用所致的多因子疾病，除遺傳因素外，環境因素中的病毒和弓形體原蟲的宮內感染對胚胎的發育影響較大，可導致胎兒嚴重的先天性畸形，如腦積水，另外，孕早期的輻射因素也會導致先天性腦積水。