腦外傷后遺癥的病因主要有以下幾點：
(1)生理因素：Montgomery等對26例外傷后遺忘不超過2小時的輕度顱腦外傷病人進行隨訪，發現半數病人在受傷后6周和6個月復查時仍存在癥狀;EEG 功率譜delta 波有改變，腦干傳導時間延擱，選擇反應時間延長。
(2)心理因素：一般說來，婦女和非技術工人易患腦振蕩后綜合征，這些人在腦外傷早期就有心理應激，其癥狀反映對意外的焦慮，對疾病和腦結構可能損傷的恐懼。其他的原因如下：
(3)素質因素：Denker對63對單卵雙生和81對雙卵雙生進行研究，發現隨訪3-25年(平均10年)，受傷的一方在腦振蕩后綜合征的發生上，素質因素所起在的作用較器質因素明顯。