泌尿系結石的高發生率，受到了很多人的重視，而由于這種病癥總是復發的特性，人們也是對它很是恐懼的。專家表示，泌尿系結石的有效根除，需要我們對此病的發生原因深度掌握。那么，造成泌尿系結石的發生病因有哪些呢?
一、環境因素
自然條件可以直接或間接對人體起作用，如炎熱的天氣下(喝的水不夠)因出汗而導致尿的濃縮，增加結石成分的飽和度，并誘發促進物的活性。
二、個體因素
1、種族遺傳：有些與結石有關的疾病，如腎小管性酸中毒、胱氨酸尿癥，都是由于常染色體的顯性或隱性遺傳所致的腎小管功能障礙，原發性高草酸尿癥和高嘌呤尿癥及某些高尿酸血癥，也起源于先天性酶缺乏。
2、疾病：一些內分泌失調的疾病，如甲狀腺的疾病，甲狀腺素它的分泌是否正常，跟鈣的吸收和利用有很大關系。甲狀旁腺機能亢進癥導致骨鈣大量溶解并促進腸道鈣的吸收引起的高血鈣和高尿鈣，也是尿石癥的一個重要原因。
3、飲食習慣和機體的適應能力：有些人喜歡吃含鈣、含草酸、鹽這樣的食物，如草莓、巧克力、堅果、豆塊等;還有一天喝不到兩杯水的，也很容易長結石;長期喝礦泉水的(最好是蒸餾水和礦泉水交替喝);高蛋白的飲食，蛋白質太高的飲食會影響鈣跟磷的代謝，跟鈣的吸收，所以增加了腎結石的機會;鈣是在小腸里進行吸收的，再好的鈣吸收率不超過40%(吸收鈣最好的是母乳)，不吸收的部分從大便排出。但缺鈣時，食物就會從尿道排出，那些多余的鈣就會通過腎臟、尿道、小便排出。若此時，這些食物跟身體里面的草酸鹽，或另外食物的草酸鹽結合，就很容易形成草酸鈣，由腎臟進入尿道，并堵塞尿道。不能不補充鈣，但又不能補太多，按量計算。
4、藥物：潰瘍病人大量飲牛乳和堿性藥物即可產生結石——乳堿綜合癥。結石還因為矽酸鎂(含矽酸鹽)治療青光眼用乙酰唑胺、維生素D中毒或大量服用抗壞血酸(可轉變為草酸)、皮質激素及磺胺類等均可發生結石(由于激素的作用，改善了內分泌，造成了鈣、磷代謝的失常);阿司匹林也有增加尿草酸的作用，也可發生結石。
三、尿路因素
梗阻可以使尿中已形成的晶體或顆粒滯留，繼續長大成石;還可以合并成染。