腎結(jié)核的病原菌主要是來自肺結(jié)核，也可來自骨關(guān)節(jié)結(jié)核、腸結(jié)核等其他器官結(jié)核。結(jié)核桿菌傳播至腎臟的途徑有四：①血行播散：是最主要的感染途徑。結(jié)核桿菌從肺部結(jié)核病灶中侵入血流而播散到腎臟;②尿路感染：實際上是結(jié)核桿菌在泌尿系統(tǒng)內(nèi)的蔓延擴散。為一側(cè)尿路發(fā)生結(jié)核病變后，結(jié)核桿菌由下尿路回流上升傳至另一側(cè)腎臟;③淋巴感染：為全身的結(jié)核病灶或淋巴結(jié)核病灶的結(jié)核桿菌通過淋巴道播散到腎臟;④直接蔓延：是在腎臟附近的器官如脊柱、腸的結(jié)核病灶直接擴散蔓延累及腎臟。

　　大量的實驗研究、尸檢和臨床觀察證實，血行播散是腎結(jié)核的主要感染方式。結(jié)核桿菌隨血流侵入腎臟。當腎臟有一定的敏感性(如局部血循環(huán)障礙、外傷等因素)或細菌數(shù)量增多形成栓子，則首先在腎外層皮質(zhì)部分的腎小球毛細血管叢中形成結(jié)核病灶。90%發(fā)生在皮質(zhì)，10%左右發(fā)生在髓質(zhì)。這種外層的結(jié)核是多發(fā)性的，幾乎兩側(cè)同時累及。但在此時往往因為人體的全身免疫和局部抵抗力的增強，細菌數(shù)量和細菌毒力下降等因素，絕大多數(shù)病例的全部病灶均可愈合而不引起任何病象，也不被發(fā)覺。但在這時期，可在尿液中查見結(jié)核桿 菌，這種時期稱為“病理性腎結(jié)核或臨床前期腎結(jié)核”。在腎外層的病灶存在期間，由于當時機體抵抗力下降、細菌毒力增加或局部因素等情況，有個別病灶不愈合而進一步發(fā)展，達到所謂“臨床期腎結(jié)核”。肺結(jié)核病人中約1～2%有這種臨床期腎結(jié)核。在腎外層結(jié)核病灶中僅3～7%發(fā)展到臨床期腎結(jié)核的階段。

　　一般從無癥狀的臨床前期腎結(jié)核發(fā)展到臨床期腎結(jié)核需要經(jīng)歷較長的時間，在這一段時間中肺部或其他器官結(jié)核的原發(fā)病灶可能已經(jīng)痊愈，因此在相當部分的腎結(jié)核病人不能發(fā)現(xiàn)其原發(fā)病變。如果臨床前期腎結(jié)核的病灶不愈合則發(fā)生局部擴散或沿著腎小管向下蔓延到腎內(nèi)層在髓質(zhì)部分，腎乳頭發(fā)生潰瘍，當病灶逐漸擴大破潰，即侵入腎盞或腎盂。這種侵入腎內(nèi)層引起臨床腎結(jié)核的病例，85%以上是單側(cè)性病變，雙側(cè)性腎結(jié)核約15%左右。臨床上的雙側(cè)腎結(jié)核，既可直接從早期的雙側(cè)性病理腎結(jié)核發(fā)展而來，也可由一側(cè)腎結(jié)核另一側(cè)假象愈合而以后再發(fā)展而成，也可由一側(cè)性臨床腎結(jié)核經(jīng)尿路感染蔓延到對側(cè)而成。