1、梗阻與返流
男性泌尿系梗阻和返流都會引起尿流的異常改變，從而使尿液引流不通暢，而使尿液潴留于泌尿道內，容易使細菌滋生造成感染。一種是機械性梗阻，如結石、異物、慢性炎癥等。另一種是神經功能性梗阻和返流，如先天性解剖缺陷、巨輸尿管、輸尿管膀胱返流等。
2、糖尿病
糖尿病會造成患者機體代謝功能紊亂和免疫功能的改變，從而易引起感染，而且一旦出現感染就不易控制。臨床顯示糖尿病病人尿路感染的發生率比正常人高5倍。因此糖尿病患者應避免尿路的器械檢查。如必需檢查，應先控制血糖，然后再檢查，同時應盡量控制尿內的細菌生長。
3、先天性畸形
泌尿系統常也是引發男性泌尿感染的原因。有許多先天性畸形，如馬蹄腎、異位腎、腎輸尿管的交界處狹窄、雙輸尿管雙腎盂畸形、膀胱外翻、輸尿管開口異位等，這些情況往往都能夠引起泌尿系梗阻而引起感染。
4、其他
患者的抵抗力下降，疲勞過度，營養不良，常期應用激素和免疫缺陷等。有些患者是因為接觸泌尿系統檢查的設備而被感染。又如尿路結石，結石除了可以引起尿路梗阻外，還會有分解尿素的細菌使尿液呈堿性，促使鎂、銨、磷酸鹽等沉著發生結石，也能以細菌為中心外圍晶體沉著而形成感染性結石。