系統性紅斑狼瘡是一種臨床表現復雜、對人體損害嚴重、較難治愈的疾病，單一的治療很難奏效，多需要綜合治療才能獲得較滿意的治療效果。
1、生活方式治療
生活方式治療包括心理干預和生活調理等等，系統性紅斑狼瘡患者的心理難免會有心理壓力和不良情緒，為了促進恢復，需要鼓勵患者樹立戰勝疾病的信心，保持積極樂觀的心態;另一方面注意勞逸結合，調整飲食結構，避免陽光暴曬，適當參加社會和文體活動。
2、藥物治療
使用藥物是治療系統性紅斑狼瘡的重要方法，常用的藥物包括非甾體類抗炎藥、抗瘧藥、腎上腺皮質激素和免疫抑制劑等幾類，藥物治療可以有效的控制和緩解患者的不適癥狀，但同時也會產生一定的副作用，因此應注意合理應用。
3、血漿置換療法
血漿置換療法多用于急重型病例，該法是通過去除患者的血漿，達到去除免疫復合物、自身抗體等物質的作用，然后再為患者輸入正常的血漿。治療效果顯著，但很難長久堅持，一方面是對醫療設備及操作醫生的要求較高，另一方面患者也要承受較高的醫療費用。
除此以外，尚有血液透析、免疫吸附療法、大劑量免疫球蛋白靜脈沖擊治療、白細胞置換療法、造血干細胞移植等治療方法可使用。