理論研究：對于混合結締組織病 MCTD和重疊綜合征，在中醫典籍中并無明確記載和詳細論述。但對該病所反應出來的一系列臨床癥狀和表現，又能從中醫理論中找到類似甚至較為詳盡的描述和辨證治療的方法。
《靈樞.九問》說："百病之始生也，皆生于風寒暑陰陽喜怒，飲食居住，大卒驚恐。"經過大量資料研究和長期的臨床治療觀察，認為本病的發病原因既有外在環境(風雨寒濕之類的氣候變異)的干擾，又有內在環境(喜、怒、憂、思、悲、恐、驚七情波動)的紊亂，還有飲食不潔不節、起居勞作不慎諸多方面的因素。
主要反應在如下兩個方面。
一是身體素虛：以先天稟賦不足者居多，加上后天失養失調(如過度勞累、營養不良、久病失治等)或因七情內傷郁結導致氣血不足，經絡阻滯而發病。
二是臟腑損傷：在MCTD和重疊綜合征患者，五臟六腑皆可受累。然而在諸臟中尤以腎臟首當其沖而受到損害。腎為先天之本，為人體水火之宅，其受損后往往造成腎陰不足，水虧火旺，虛火內生，而產生一系列臨床癥狀。
此外，若患者外遇淫邪暴襲，不管是內攻臟腑還是外阻經絡，都會導致虛實夾雜的臨床表現，因此，治療本病必須標本兼治，攻補兼施，本著急則治其標，緩則治其本的原則，在整個過程中調整方藥，以獲痊愈之功。
在臨床治療中，要根據每個患者的不同表現、不同病期、不同損害部位，隨證加減化裁。