肝膿腫是一種特別容易與肝癌混淆的疾病，尤其是少數不典型的肝膿腫，癥狀與肝癌相似，更容易使醫生做出錯誤的診斷，這就需要患者自身對兩種疾病都有所了解，在臨床診斷時，為醫生提供更有效的參考信息。
肝膿腫主要有兩種：一種是細菌性肝膿腫，一種是阿米巴性肝膿腫。細菌性肝膿腫往往因為膽道炎癥或敗血癥沒有得到有效控制，細菌經膽道逆行進入肝臟，或者經血液循環進入肝臟，在肝臟中形成膿腫。阿米巴性肝膿腫是一種叫阿米巴原蟲的致病微生物引起的，常表現為肝臟右葉的巨大性病灶。
臨床上細菌性肝膿腫較常見，典型癥狀包括發熱，白細胞升高，肝區疼痛，B超或CT可見病灶中央液性暗區和周圍炎癥水腫帶的表現，一般不難與肝癌鑒別。
但少數不典型的肝膿腫，特別在其病程初期，容易和甲胎蛋白陰性而又有中心壞死的肝癌混淆，引起誤診，此時就需要仔細了解病史，肝膿腫多有發熱或菌痢病史，多伴有血白細胞增高，如果給予抗感染治療，病灶會在短期內縮小。而肝癌則多有乙肝或肝硬化的病史，血白細胞少有升高。