尿道炎可分為兩類，淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎。前者是指淋病雙球菌致成的尿道炎，也稱為特異性尿道炎。而后者則指的是淋病雙球菌以外的其它微生物所致的尿道炎，也稱為非特異性尿道炎。在診斷非淋菌性尿道炎時，要以淋病及慢性前列腺炎相鑒別診斷。
淋病
是由淋病奈瑟菌(簡稱淋球菌)引起的泌尿生殖系統的化膿性感染，也可侵犯眼睛、咽部、直腸和盆腔等處以及血行播散性感染，是常見的性傳播疾病之一。潛伏期2～3天，排尿困難，尿痛明顯，尿道分泌物量多，呈膿性，其中含有革蘭陰性雙球菌。
慢性前列腺炎
包括慢性細菌性前列腺炎和非細菌性前列腺炎兩部分。其中慢性細菌性前列腺炎主要為病原體感染，以逆行感染為主，病原體主要為葡萄球菌屬，常有反復的尿路感染發作病史或前列腺按摩液中持續有致病菌存在。非細菌性前列腺炎是多種復雜的原因和誘因引起的炎癥、免疫、神經內分泌參與的錯綜的病理變化，導致以尿道刺激癥狀和慢性盆腔疼痛為主要臨床表現，而且常合并精神心理癥狀的疾病，臨床表現多樣。