肛瘺的發病，多數是因為肛周膿腫自行破潰，或者是切開引流后，未徹底愈合而形成，少數因結核形成。做好肛瘺的保健措施，要從兩方面入手：
1、預防保健
肛瘺目前尚無較好的預防方法，宜采用綜合措施改善局部血液循環，增強清潔衛生，經常清洗或坐浴，同時要預防便秘、腹瀉、肛周膿腫的發生。
2、康復保健
肛瘺一旦形成立即進行抗感染治療，并注意臥床休息，減少活動。飲食清淡易消化，忌食刺激性食物。局部可熏洗，坐浴或熱敷。發現了肛瘺癥狀以后，要及時的進行治療，以防病癥發展，給治療帶來難度。
建立正常的膳食習慣，因肛瘺的發生與濕熱有關，對于油膩飲食，可以內生濕熱，所以不宜多吃。應多吃清淡含豐富維生素的食物，如綠豆、蘿卜、冬瓜等新鮮蔬菜、水果。對經久不愈的肛瘺多為虛證，飲食上多吃含蛋白質類食品，如瘦肉、牛肉、蘑菇等。 及時治療肛竇炎、肛乳頭炎，以免發生肛管直腸周圍膿腫及肛瘺。
肛門灼熱不適、肛門下墜者，要及時查清原因，及時治療。防治便秘和腹瀉，對預防肛管直腸周圍膿腫有重要意義，因為大便干結容易擦傷肛竇，再加上細菌侵入而感染。腹瀉者多半有直腸炎和肛竇炎的存在，可使炎癥進一步發展。積極治療，不積極治療可能會引起肛管直腸周圍膿腫的全身性性病，如潰瘍性結腸炎、克隆氏病等。養成良好的排便習慣，每日排便后坐浴保持肛門清潔，對預防感染有積極作用。