排便困難常見的病因有習慣性便秘、神經系統病變、結腸腫瘤等。急性的排便困難多由于急性感染或由腸梗阻引起。
(1)習慣性排便困難
病史中一般有偏食、不吃蔬菜或飲食過于精細的習慣，或自幼未養成按時排便的習慣。廁所不方便或工作環境對排便不便，情緒緊張對習慣性便秘也有影響。
(2)腸易激綜合征
腸易激綜合征臨床上有三種表現類型：結腸痙攣、慢性間斷性無痛性水瀉、便秘與腹瀉交替。
(3)瀉藥性腸病
患者為了排便通暢，開始應用瀉藥，長期應用造成排便對瀉藥的依賴性稱為瀉藥性腸病。
(4)大腸癌
大腸癌包括結腸和直腸癌。大腸癌的早期癥狀不明顯，排便習慣的改變如便秘或腹瀉、或兩者交替可能是大腸癌的早期表現;便后出血是大腸癌常見的癥狀。
(5)巨結腸
巨結腸是指結腸顯著擴張伴有嚴重排便困難。可發生于任何年齡，可為先天性或后天獲得性的。
(6)其他原因引起的排便困難
急性便秘多見腸梗阻，腹部手術后的腸粘連，中毒性巨結腸，急性腹膜炎、腸套疊等。