1.伴有口咽、肢體肌無力的疾?。喝缂I養不良、肌萎縮側索硬化、神經癥或甲亢引起的肌無力、其他原因引起的眼肌麻痹。眼肌痙攣偶見伴有輕度眼肌無力，但其眼瞼閉合力弱涉及上、下眼瞼。這些疾病根據病史、神經系統檢查、電生理檢查和新斯的明試驗不難與MG鑒別。
2.Lambert-Eaton綜合征：多數50歲以后起病，男性多見;多伴發腫瘤，以小細胞型肺癌最多見;主要是四肢近端的軀干肌肉無力，下肢癥狀重于上肢;消瘦和易疲勞，行動緩慢。肌肉在活動后即感到疲勞，但如繼續進行收縮則肌力反而可暫時改善;偶見眼外肌和延髓支配肌肉受累;約1/2病例有四肢感覺異常、口腔干燥、陽萎;陽堿酯酶抑制劑對治療無效。腱反射減弱但無肌萎縮現象。而重癥肌無力40歲以下女性多見;常伴胸腺腫瘤;全身肌肉均可受累，以活動最多的肌肉受累最早;肌無力晨輕午重，活動后加重，休息后減輕或消失;腱反射通常不受影響;膽堿酯酶抑制劑治療有效。
3.藥物中毒：肉毒桿菌中毒、有機磷農藥中毒、蛇咬傷所引起的神經-肌肉傳遞障礙，用新斯的明或依酚氯銨后臨床癥狀也會改善，但這些疾病都有明確的病史。其中肉毒桿菌中毒有流行病史，其毒素作用在突觸前膜，影響神經-肌肉接頭的傳遞功能，出現骨骼肌癱瘓;應及時給于鹽酸胍治療，靜脈注射葡萄糖和生理鹽水。