生殖器流褐色分泌物的原因包括宮頸炎、先兆流產、細菌性前列腺炎等。

一、宮頸炎：當患有宮頸炎時，炎癥長時間對子宮頸組織產生刺激，會致使毛細血管破裂，進而出現出血現象，從而導致生殖器有流褐色分泌物的狀況。患者應及時前往醫院婦科就診，一般需要在醫生指導下口服甲硝唑或阿奇霉素等藥物來進行醫治。

二、先兆流產：對于處于妊娠期的女性，如果生殖器出現流褐色分泌物的情況，就需要警惕是否是由先兆流產引起的。此時需要及時臥床休息，減少活動量，必要時要到醫院進行保胎治療。

三、細菌性前列腺炎：若是男性，多數情況下是因為細菌性前列腺炎導致的，主要表現為尿頻、尿急、尿痛等癥狀，也可能伴有褐色分泌物排出的現象。這需要在專業醫生的指導下口服氨芐西林或者阿莫西林等藥物予以治療。

總之，當生殖器出現流褐色分泌物時，需要根據具體情況明確原因，并采取相應的治療措施。