孩子指甲有凹陷可能涉及的原因包括：營養不良、甲溝炎、甲癬。具體如下：

一、營養不良：指甲的良好生長依賴于充足營養供應。若孩子存在營養不良狀況，機體可能缺乏鈣、鐵、鋅、硒等微量元素以及維生素，這就會對指甲生長產生影響，進而導致指甲出現凹陷。比如，缺鈣可能影響指甲的硬度和形態，缺鐵可能使指甲缺乏光澤等。

二、甲溝炎：孩子若有撕扯倒刺、不當修剪指甲等行為，容易使甲床形成微小創傷，破壞指甲周圍的皮膚屏障，這樣金黃色葡萄球菌、白色念珠菌等病菌就易于侵入，引發炎癥，表現出指甲紅腫、發熱、疼痛等癥狀，嚴重時還可致使指甲變形，呈現凹陷狀態。

三、甲癬：通常由紅色毛癬菌、須癬毛癬菌等病菌感染所致，孩子很可能出現指甲凹陷現象，同時指甲的甲根還可能出現增厚、粗糙、破損等情況。比如，感染紅色毛癬菌后，指甲的質地和形態會逐漸發生改變。

總之，當發現孩子指甲有凹陷時，需綜合考慮可能的原因，必要時應及時就醫進行準確診斷和恰當治療。