同房后小便時尿道刺痛可能與尿道結石、前列腺炎、尿道炎等疾病有關。

一、尿道結石：在同房過程中，結石會發生活動，而這很可能對尿道黏膜形成刺激。當存在尿道結石時，就容易在同房后出現小便時尿道刺痛的表現。

二、前列腺炎：前列腺炎患者的前列腺組織會因炎癥刺激而有炎性分泌物增多以及充血水腫的情況，這種狀態下也會導致在同房后有小便時尿道刺痛的癥狀出現。

三、尿道炎：一旦發生尿道炎，可能會產生較多炎性分泌物，這些分泌物會對尿道組織產生刺激，進而引發在同房后小便時尿道刺痛的現象。

總之，同房后小便時尿道刺痛可能是多種疾病引起的，需要根據具體情況進行分析和診斷，以便采取合適的治療措施。