包皮里面有小肉疙瘩可能由尖銳濕疣、珍珠狀陰莖丘疹、包皮龜頭炎等疾病導致。

一、尖銳濕疣

這是一種由人乳頭瘤病毒感染引起的傳染性疾病，會累及生殖器官、肛門等多處部位。當病變發生在龜頭部位時，會使包皮內出現小肉疙瘩。隨著病情進一步發展，還會出現菜花狀、乳頭狀的贅生物。其主要原因就是人乳頭瘤病毒的感染。

二、珍珠狀陰莖丘疹

是發生在冠狀溝和陰莖冠狀邊緣的皮膚疾病。發病原因與生理發育異常以及局部刺激有密切關系。由于局部皮膚發生病變，進而會導致包皮內有小肉疙瘩出現。

三、包皮龜頭炎

可能是平時不注重個人衛生清潔，比如內褲不常更換或不常用水清洗，致使病原微生物在龜頭部位滋生從而誘發炎癥反應。因炎癥刺激，會使龜頭部位出現潰瘍，也就會引起包皮里面有小肉疙瘩。

總之，當發現包皮里面有小肉疙瘩時，要考慮可能是以上這些疾病，應及時就醫進行明確診斷和相應治療。