龜頭底部發黑存在生理性和病理性原因。生理性原因主要是男性性發育時，隨著雄性激素分泌，第二性征表現為陰莖變大、變長、變粗，會陰部出現色素沉著，導致陰莖龜頭及陰囊都變黑，這無需特殊處理。病理性原因包括：

一、龜頭黑斑，是由黑色素長期沉積引起，不會對龜頭造成損傷，通常也無需特殊處理。

1.形成原因：黑色素的長期沉淀。

2.特點：不會對龜頭產生損害。

二、龜頭炎，可使局部血液不暢從而引起龜頭發黑。

1.治療方法：應在醫生指導下口服消炎藥物，如配合外涂紅霉素軟膏等抗炎藥膏，且要經常清洗龜頭。若反復發作且存在包皮過長，可考慮進行包皮手術。

(1)口服藥物：在醫生指導下選擇合適的消炎藥物。

(2)外用藥物：如紅霉素軟膏等。

(3)日常護理：經常清洗龜頭。

(4)手術考慮：若反復發作且包皮過長，可考慮包皮手術。

總之，若反復出現龜頭發黑的情況，患者需及時到醫院檢查并在醫生指導下進行治療。