陰莖上面長小疙瘩可能考慮以下因素：

一、陰莖珍珠疹：這通常是因生理發育變異引發的丘疹，多呈白色、膚色或淡紅色，無疼痛和瘙癢感，屬于良性皮膚病變，一般無需特殊治療。

二、包皮龜頭炎：這是由多種因素導致的包皮和龜頭黏膜炎癥性疾病。患者往往會有局部紅斑、糜爛、出血，嚴重時可形成水皰，并有大量豆腐渣樣白色分泌物。治療上，通常可使用紅霉素軟膏、硝酸咪康唑軟膏等藥物進行局部涂抹，癥狀可得到改善。

三、尖銳濕疣：由人乳頭瘤病毒感染引起，以肛門生殖器部位增生性損害為主要表現的性傳播疾病。患者局部會出現雞冠樣或菜花樣丘疹，表面角化過度且粗糙，觸摸有疼痛感。治療上通常以抗病毒藥物為主，如伐昔洛韋、阿昔洛韋等。

總之，當陰莖出現小疙瘩時，要根據具體表現來判斷可能的原因，并采取相應的治療措施。如果自己不能確定，應及時就醫，以便準確診斷和治療。