巧克力囊腫懷孕后可能會消失。

巧克力囊腫是子宮內膜異位癥的一種病變，是指異位的子宮內膜在卵巢皮質內生長，形成單個或多個囊腫，囊內含暗褐色黏糊狀陳舊血，似巧克力糊狀。巧克力囊腫可導致患者痛經、性交痛、月經異常等，還可能引起不孕。懷孕后，卵巢內的異位子宮內膜會停止生長，甚至萎縮，因此巧克力囊腫可能會消失。

需要注意的是，巧克力囊腫是否會消失以及消失的概率因人而異。此外，即使巧克力囊腫消失，也不能忽視子宮內膜異位癥的其他影響。如果患者有生育需求，應在醫生的指導下進行備孕。如果巧克力囊腫較大或引起明顯癥狀，可能需要進一步治療。

對于巧克力囊腫患者，尤其是有生育需求的患者，建議及時就醫，進行詳細的檢查和評估，并根據醫生的建議進行治療和備孕。同時，患者在備孕期間應注意保持良好的生活習慣，均衡飲食，適量運動，保持心情愉悅，有助于提高受孕率。