女性肛門疼痛的治療方法因病因而異，可能包括外用鎮痛藥、栓劑、口服鎮痛藥、抗生素及其他促進傷口愈合的藥物等，需在醫生指導下使用。

1.外用鎮痛藥

如利多卡因凝膠等，可直接涂抹在肛門周圍，減輕疼痛。

2.栓劑

如痔瘡栓劑，可緩解肛門疼痛和腫脹。

3.口服鎮痛藥

如對乙酰氨基酚等，可緩解輕度至中度的疼痛。

4.抗生素

如果肛門疼痛是由感染引起的，醫生可能會開抗生素進行治療。

5.其他藥物

如果肛門疼痛是由肛裂等疾病引起的，醫生可能會開一些促進傷口愈合的藥物。

需要注意的是，以上藥物應在醫生的指導下使用，避免自行用藥。此外，女性肛門疼痛可能是嚴重疾病的癥狀，如直腸癌等，因此，如果疼痛持續不緩解或伴有其他癥狀，應及時就醫，進行詳細的檢查和診斷。