深呼吸時肺部不舒服可能由肺部、心臟、胸部疾病及其他原因引起，建議及時就醫，進行相關檢查，明確病因，并進行相應治療，同時注意休息、保暖、保持良好心態。

1.肺部疾病

肺炎、肺氣腫、肺栓塞等肺部疾病都可能導致深呼吸時肺部不舒服。

2.心臟疾病

心臟疾病如心力衰竭、心律失常等也可能導致深呼吸時肺部不舒服。

3.胸部疾病

胸部外傷、肋軟骨炎、胸膜炎等胸部疾病也可能導致深呼吸時肺部不舒服。

4.其他

貧血、低血糖、自主神經功能紊亂等也可能導致深呼吸時肺部不舒服。

如果出現深呼吸時肺部不舒服的癥狀，建議及時就醫，進行相關檢查，如胸部X線、CT、心電圖等，以明確病因，并進行相應的治療。同時，在日常生活中，應注意休息，避免勞累和劇烈運動，保持心情舒暢，避免緊張和焦慮等不良情緒。