腎結石排出來了依然腰疼，原因可能包括泌尿系統存在梗阻、結石未完全排凈或是腎損傷等。

一、結石梗阻：在腎結石排出時，即便最小的結石也可能在尿道中形成堵塞，引發結石梗阻情況，進而表現為腰痛。比如結石在輸尿管狹窄處卡住，導致尿液無法順暢排出，引起腰部疼痛不適。

二、結石未排干凈：有可能部分結石尚未徹底排出，殘留的結石在腎組織內活動，所以依然會有腰疼癥狀。這些殘留的小結石可能會繼續刺激腎臟組織，導致疼痛持續存在。

三、腎損傷：腎結石在排出過程中可能會刮傷腎臟黏膜，即便結石已排出，但受損的腎組織尚未愈合，因此會出現腰疼現象。就如同皮膚被劃傷后，在傷口未痊愈時會有疼痛一樣。

此外，也可能是腰肌勞損所導致。如果腰疼癥狀較為嚴重，務必及時就醫進行詳細檢查和診斷，以便明確具體原因并采取針對性的治療措施。

總之，腎結石排出后腰疼的原因多樣，需要仔細甄別，及時處理。