肛瘺手術的疼痛等級通常在3-6級之間，但這個手術是在麻醉下進行的，所以疼痛感是在人體可承受的范圍內的。

肛瘺可以分為高位肛瘺和低位肛瘺兩種。由于高位肛瘺的位置較深，所以手術的疼痛等級可能會稍高一些，大約在6級左右。而低位肛瘺的位置較淺，手術的疼痛等級一般在3級左右。需要強調的是，手術后患者在平時并不會感到明顯的疼痛，這時的疼痛等級通常也在3級左右。但是，當肛瘺患者排便時，可能會感到較明顯的疼痛，此時的疼痛等級可能達到6級。

建議患者不要過度擔心手術疼痛的問題。手術時一般選擇局部麻醉，當然也可以選擇全身麻醉。