生殖器皰疹是否會自愈，需要分情況判斷。

如果病情比較輕微，且沒有出現明顯的不適癥狀，免疫功能正常時，通常能夠更有效地抵抗病毒侵襲，達到自愈。但如果病情比較嚴重，出現了生殖器疼痛、瘙癢、潰瘍等癥狀，此外有長期熬夜、大量飲酒等情況，通常體內病毒會大量復制，一般無法自愈。

生殖器皰疹的患者需要遵循醫囑使用抗病毒藥物，如阿昔洛韋、伐昔洛韋、奧司他韋等，抑制病毒復制，減輕癥狀并加速病程愈合。患者治療期間，需要及時定期到醫院復查，方便及時調整治療方案。