E6/E7陽性，HPV分型陰性可能是感染早期、病毒清除后、檢測方法差異等原因導致，具體如下：

1、感染早期

如果是在HPV感染早期就接受了檢測，此時HPV病毒量較少，分型檢測未能檢測到，但E6/E7基因已經活躍。

2、病毒清除后

患者之前確實感染了HPV，但經過治療后病毒已被清除，但E6/E7基因的表達痕跡仍然存在。

3、檢測方法差異

HPV分型檢測可能由于技術原因而未能檢測到病毒，但E6/E7檢測更為敏感，能夠捕捉到病毒的存在。