動脈瘤樣骨囊腫的病因并未完全明確，一般情況下和血液動力障礙、創傷、骨病變等原因引起的。

1.血液動力障礙

患者局部組織出現長時間血液動力障礙的情況時，可造成其靜脈內的壓力進一步增高，導致血管異常擴張，從而導致發生動脈瘤樣骨囊腫的情況。

2.創傷

患者局部骨組織發生骨折或骨創傷的情況時，可造成其患肢骨血液循環出現異常，患者此時也會出現動脈瘤樣骨囊腫的情況。

3.骨病變

骨母細胞瘤、血管瘤、骨肉瘤等疾病導致患者的骨組織發生病變時，其病變部位的血管可能會出現血管膨脹的情況，引發動脈瘤樣骨囊腫的形成。