眼角眨眼睛疼可能是由于麥粒腫、青光眼、結膜炎導致的，根據不同病因有不同治療方法。

1、麥粒腫

患者需要保持眼部衛生清潔。如果出現感染，同時可以在醫生指導下選擇左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、諾氟沙星滴眼液等抗生素滴眼液，控制感染。

2、青光眼

患者可以遵醫囑選擇馬來酸噻嗎洛爾滴眼劑、拉坦前列素滴眼液、酒石酸溴莫尼定滴眼液等藥物降低眼壓，緩解癥狀。

3、結膜炎

根據不同類型的結膜炎需要選擇不同的藥物。如果是病毒性結膜炎，可以遵醫囑選擇阿昔洛韋滴眼液、更昔洛韋滴眼液、重組人干擾素α2b滴眼液等藥物緩解癥狀。